Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms