Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms