Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
REREQ9P2R6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms