Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms