Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms