Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms