Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms