Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKRIP1Q9H875 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms