Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms