Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms