Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms