Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms