Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms