Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE1Q96RT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE1Q96RT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms