Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms