Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms