Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRAC1Q96KF2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms