Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms