Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC51Q96ER9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC51Q96ER9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms