Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms