Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC71LQ8N9Z2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms