Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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RAB11FIP4Q86YS3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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