Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RWDD4Q6NW29 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms