Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC183Q5T5S1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms