Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms