Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR2Q2VWA4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms