Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms