Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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