Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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