Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms