Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms