Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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