Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB35Q15286 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB35Q15286 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB35Q15286 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB35Q15286 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB35Q15286 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB35Q15286 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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