Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms