Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms