Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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