Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGADQ13349 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGADQ13349 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms