Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms