Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms