Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IP78347 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms