Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB4BP68371 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms