Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms