Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD2P62316 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms