Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP107P57740 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms