Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms