Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD247P20963 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD247P20963 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD247P20963 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms