Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms