Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASTP20810 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASTP20810 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASTP20810 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASTP20810 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CASTP20810 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASTP20810 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASTP20810 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASTP20810 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASTP20810 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASTP20810 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASTP20810 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASTP20810 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms