Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms