Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC3P02656 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC3P02656 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms